大理白族自治州境内地理环境复杂多变，具有北温带至南亚热带6个气候带的优越自然条件，药用动植物资源十分丰富。以白族为主的23个少数民族在长期的生存斗争中还开发应用了不少独具特色的民族药。
大理白族自治州境内山脉起伏、森林茂密，河流纵横，日光充足、雨量适中，各种药用动、植物的生长繁殖条件极为优越。气候、土壤、植被形成了垂直分布的植物区系。药用动、植物资源分布面积约为3200万亩，占全州总面积的75％。
动、植、药资源的水平分布：
以大理州中部的点苍山划分，全州药材资源分为东、西两区：
西区为地处横断山脉南段的洱源、大理、鹤庆、剑川、永平、漾濞、巍山、云龙8县（市），多属山区或高寒山区，气候属温带或寒温带，是大理州中药资源的主要分布区域。主要野生药用植物品种为：苍山贝母、珠子参、前胡、独活、柴胡、草乌、云黄连、马尾黄连，丹参、黄芩、岩白菜、龙胆、三棵针、十大功劳、大理藜芦、天南星、半夏、茯苓。主要动物药材品种为：麝香、穿山甲、熊胆、豹骨、牛黄、脆蛇、猴骨等。
东区为地处云贵高原西部边缘地带的祥云、弥渡、南涧、宾川等4县。山势较西区平缓，海拔较西区低。地处红河与金沙江两水系之间，支流较多，气候较西区暖和，雨量偏少。主要分布亚热带植物，其品种与数量较西区少。主要野生药用植物品种为：黄芩、龙胆、防风、前胡、通光散、茯苓、续断、威灵仙、仙鹤草、苦楝子、天冬、补骨脂、何首乌、余甘子、千张纸、紫金龙、桔梗等。主要动物药材品种为：麝香、豹骨、脆蛇等。
大理市地处东西两区的中部地带，市境西部为著名的点苍山，最高海拔4122米。野生药用植物是明显的垂直分布。山麓一带分布的药用品种主要为：车前草、马鞭草、蒲公英、益母草、苍耳子、黄芩、防风、千金子、八角枫、青阳参、旋覆花、地榆、大红袍、白及、灯盏细辛、过路黄、叶上花等。点苍山中上部分布的主要品种为：茯苓、天麻、独钉子、旋覆花、前胡、草血竭、沙参、五味子、青阳参、滇紫菀、珠子参、猪苓、刺参、高河菜、羌活、大理藜芦等。在海拔3500米以上的高山寒温带主要分布品种为：苍山贝母、高河菜、雪茶、雪莲花、岩白菜、黄杜鹃等。市境东部的洱海分布有弓鱼、鲤鱼、鱿鱼、白虾、海螺、水蛭等动物药材及海菜花、菱角、芦根等药用水生植物资源。
药材资源的垂直分布：
大理白族自治州药用植物资源的垂直分布划分为河谷区、低山区、中山区、高山区4类：
河谷区：海拔为1500米以下，总面积约为1500平方公里的河谷地带，适宜热带、亚热带药材生长，是品种少、蕴藏量小的药材分布区。主要品种为：余甘子、紫珠、木蝴蝶、吴茱萸、钩藤、黄草、补骨脂、矮陀陀、地不容、红花、香附、香橼、佛手等。主要动物药材品种为：脆蛇、滚山虫、灵猫香等。
低山区：海拔为1500～2300米，总面积约为15000平方公里的低山区盆地和丘陵，野生药材资源较多，主要分布的品种为：车前草、马鞭草、荆芥、牛蒡、虎掌草、马齿苋、bian蓄、虎杖、黄芩、灯盏细辛、红大戟、楮实子、积雪草、商陆、半枝莲、天丁、防风、青叶胆、蒲公英、益母草、苍耳子、白花蛇舌草、半夏、南星、重楼、雷公藤、青阳参、独钉子、薄荷、白及、紫苏、金银花、广藿香等。
中山区：海拔为2300～2800米，总面积约为7000平方公里的中山地带具有丰富的药用植物资源，是大理州的主要药材产区。其主要分布品种为：茯苓、紫草、龙胆、续断、三棵针、羌活、鸢尾、前胡、雷公藤、苦参、重楼、天麻、草血竭、沙参、大理藜芦、百合、紫金龙、半夏、南星、白云花根、黄精、玉竹、十大功劳、升麻、高河菜、青阳参等。
高山区：海拔为2800米以上，面积约为3000平方公里的高山和亚高山地带。主要分布的药材品种为：云黄连、草乌、珠子参、鹿仙草、大理鹿蹄草、三分三、紫菀、青木香、竹红菌、高河菜、贝母、秦艽、岩白菜、雪上一枝蒿、金不换、雪莲花、雪茶等。